Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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