Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms