Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms