Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep55Q8BT07 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms