Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BPC6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms