Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfr1Q8BP27 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms