Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms