Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prpf18Q8BM39 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prpf18Q8BM39 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prpf18Q8BM39 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prpf18Q8BM39 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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