Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM11

Tgm6, Transglutaminase 6, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm6Q8BM11 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgm6Q8BM11 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms