Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms