Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc40Q8BI79 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms