Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gabra5Q8BHJ7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra5Q8BHJ7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms