Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm29Q8BGX2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms