Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atg4dQ8BGV9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atg4dQ8BGV9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atg4dQ8BGV9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atg4dQ8BGV9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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