Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best2Q8BGM5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best2Q8BGM5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms