Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD0

Uncharacterized protein C3orf14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGD0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGD0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BGD0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms