Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms