Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrde2Q80XC6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms