Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms