Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ell3Q80VR2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ell3Q80VR2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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