Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms