Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rims3Q80U57 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rims3Q80U57 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rims3Q80U57 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rims3Q80U57 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rims3Q80U57 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rims3Q80U57 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms