Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Avl9Q80U56 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms