Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf7ipQ7TT18 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms