Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdp1Q7TSG2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms