Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms