Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms