Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms