Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sbno2Q7TNB8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms