Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms