Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg4Q7TMD7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms