Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms