Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vma21Q78T54 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Vma21Q78T54 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vma21Q78T54 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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