Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms