Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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