Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc154Q6RUT8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms