Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx13Q6PHS6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx13Q6PHS6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms