Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrrn2Q6PHP6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrn2Q6PHP6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms