Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms