Protein–RNA interactions for Protein: Q6PER3

Mapre3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mapre3Q6PER3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mapre3Q6PER3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mapre3Q6PER3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms