Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms