Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms