Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trak1Q6PD31 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms