Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg2aQ6P4T0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms