Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnpo3Q6P2B1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnpo3Q6P2B1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnpo3Q6P2B1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnpo3Q6P2B1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnpo3Q6P2B1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnpo3Q6P2B1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnpo3Q6P2B1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms