Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms