Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atg16l2Q6KAU8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg16l2Q6KAU8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms