Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms