Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cep78Q6IRU7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep78Q6IRU7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms