Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hecw2Q6I6G8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms